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ATAC-Seq을 이용한 노인성 황반변성과 연관되어 있는 chromatin accessibility 확인


제목

ATAC-Seq을 이용한 노인성 황반변성과 연관되어 있는 chromatin accessibility 확인

추천 연구 논문

ATAC-Seq analysis reveals a widespread decrease of chromatin accessibility in age-related macular degeneration

선정 이유

노화의 관점을 유전자 발현량이 아니라 전사요소의 관점에서 생각해보도록 제안함.

주요 내용

Age-related macular degeneration (AMD) 는 노화와 관련된 세포의 변화로 인해서 망막 내부의 황반에서 발생하는 난시 및 시력 저하와 관련된 눈 질환이다. 해당 질환은 대부분 노인 인구에서 발생하며, 전세계적으로 실명의 주요 원인 중 하나로 밝혀져있다. 현재까지 대부분의 이런 질병의 바이오 마커들을 밝혀내기 위해서 유전자의 발현량을 활용하여 분석하였으나, 해당 연구에서는 Chromatin accessibilty 를 살펴보기위하여, ATAC-Seq 기술을 활용함. 그 결과, 실제로 AMD 질병을 가진 사람들로부터 AMD 연관 유전자들의 전사 요소와 연관된 부분에서 chromatin accessbility가 낮은 것을 확인함. 결론적으로 이러한 전사요소들이 실제로 노화와 AMD에도 연관을 끼질 수 있음을 제안함.

시사점

대부분의 연구들이 RNA-Seq을 통한 유전자 발현의 분석을 토대로 진행되어왔으나, 최근 기술의 발달로 유전자 발현에 영향을 끼치는 전사요소의 관점에서도 질병 및 노화의 원인을 생각해볼 수 있도록 제안함.


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