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CLOCK-BMAL1 complex의 관계 이해 및 저해하여 생체 리듬을 조절하는 접근


제목

CLOCK-BMAL1 complex의 관계 이해 및 저해하여 생체 리듬을 조절하는 접근

추천 연구 논문

"A CLOCK-binding small molecule disrupts the interaction between CLOCK and BMAL1 and enhances circadian rhythm amplitude"

선정 이유

CLOCK 단백질과 BMAL1 단백질 사이를 저해하는 compound를 발견했다고 보고한 연구가 소개되었다. Circadian clock에 작동하는 메커니즘은 다양한 단백질이 작동하기 때문에 굉장히 복잡한데, 이를 찾기 어려운 이유는 단백질의 어떠한 특정 부분이 어디에 어떻게 작동하는지 설명하는 것이 어렵기 때문이다. 이를 알아내기 위해, 해당 연구팀은 in silico, in vivoin vitro 실험을 통하여 circadian clock의 메커니즘에 관여하는 CLOCK과 BMAL1 단백질을 저해하는 compound의 기전을 명확하게 밝혀내어, 해당 논문을 선정하였다.

주요 내용

생체 시계에서 CLOCK과 BMAL1 단백질 사이에 CLK8라는 화합물이 어떻게 작동하는 지 in silico분야의 기술을 통해

CLOCK-binding site의 특정 잔기를 선정하였다. 그리고 해당 잔기를 mutation하였을때, 약물이 작동하지 않는 것을 발견하였고

실험을 통해 증명하였다. 또한 해당 결과는 두 단백질이 complex를 형성하지 않기 때문에 생체 시계 단백질(CLOCK-BMAL1)이

핵 안으로 들어가지 않는 것(nuclear translocation)을 in vivo와 in vitro실험을 통하여 관련 유전자의 발현 정도를 분석 및 확인하였다.

시사점

In silico 기술을 통해, 두 단백질이 함께 작동하는 complex 메커니즘을 연구하는 것은 매우 어렵다. In vivoin vitro 실험과 함께 진행한 해당 연구는 복잡한 생체시계의 메커니즘을 이해하는 데에 도움이 될 것이다.


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