CRYs를 조절하기 위한 두 번째 가능성

제목	CRYs를 조절하기 위한 두 번째 가능성
추천 연구 논문	Dynamic regulation of the serine loop by distant mutations reveals allostery in cryptochrome1
선정 이유	Cryptochromes(CRYs)는 생체 리듬을 조절하는 메커니즘에 있어 중요하다. 따라서 이를 조절하는 것은 생체 리듬에 큰 영향을 줄 수 있다. 해당 논문은 CRYs(CRY1과 CRY2)를 mutation하여 이들의 serine loop의 flexibility를 분석하고, 이를 통해 secondary pocket volume이 변화하는 것을 확인하여, 이들을 다른 binding site에서도 조절할 수 있다는 가능성을 보여주어 생체 리듬 조절을 연구하는 것에 있어 도움이 될 것이라 생각되어 해당 논문을 선정하였다.
주요 내용	해당 연구팀은 8개의 CRYs mutants를 통해, 이들이 serine loop의 flexibility를 변화시키고 그로 인해, secondary pocket의 volume이 어떻게 변하는 지 Molecular dynamics(MD) simulation을 사용하여 확인하였다. 먼저, 연구팀은 CRY1과 CRY2의 serine loop state과 secondary pocket간의 correlation을 분석하기 위해, CRYs를 총 8가지 mutation하여 wild type과 secondary pocket volume을 비교하고 serine loop residues의 backbone dihedral angles를 분석하여, CRY1의 serine loop만이 secondary pocket volume에 영향을 준다는 것을 알아내었다. 이후 CRY1 serine loop에서의 residue들의 interaction energy 계산과 이들이 hydrogen bonds를 얼마나 형성할 수 있는지를 분석하여, 최종적으로 CRY1 serine loop의 S44와 S45가 CRY1의 E382와 수소결합을 통해 상호작용하는 것이 serine loop의 flexibility에 있어 중요한 역할을 한다는 것을 알아내었다.
시사점	CRY1과 CRY2의 serine loop와 secondary pocket간의 correlation을 다양한 측면에서 분석하여, 기존의 primary pocket이 아닌 secondary pocket을 연구함으로써 한정된 binding site로 인한 제한적인 약물 개발 전략이 확장될 수 있을 것으로 보인다.