CRY의 lid loops의 고찰 구조 및 빛에 의한 고찰

제목	​CRY의 lid loops의 고찰 구조 및 빛에 의한 고찰
추천 연구 논문	Photopharmacological Manipulation of Mammalian CRY1 for Regulation of the Circadian Clock
선정 이유	CRY의 조절 연구는 일반적으로 FAD에 경쟁적으로 붙는 화합물질을 발굴 및 합성하여 생체시계를 조절할 수 있는 물질을 찾는다. 이를 통해서 ubiquitination(UB)을 조절한다. 이 논문을 작성한 Hirota 연구팀에서는 CRY1의 W399 아미노산이 해당 반응에 결정적인 역할을 한다고 보고하였다. 하지만 거기서 끝나는 것이 아닌 W399 아미노산이 lid loop를 어떻게 통제하는지 분석한 연구다. UB는 구조적으로 정말 많은 과정을 거쳐 일어나는 반응이다. 기존에 알려진 반응보다 확장된 움직임을 분석한 신약개발에 있어 결정하는 또 하나의 크리티컬한 요소가 될것될 것 판단하여 해당 논문을 선정하였다.
주요 내용	이 연구는 CRY의 FAD binding pocket를 경쟁적으로 저해하고 생체시계를 조절하는 화합물을 사용하여 구조적인 분석을 진행한 연구다. 해당 연구는 이 연구팀의 이전의 연구에서 밝힌 CRY1의 W399의 위치가 UB를 결정한다고 주장하였는데, W399의 위치가 lid loop의 F405과 F409가 어떻게 움직이는 설명하고 있다. 해당 구조로 인해 아주 독특한 conformation을 형성하게 되고 빛에 민감한 benzophenone 모이어티가 어떻게 빛에 의해서 영향을 받는지, 나아가 어떻게 빛에 의해서 조절이 생체시계가 조절이 가능한지 추측하였다.
시사점	해당 연구의 시사점은 CRY1의 UB 조절 메커니즘의 초기 반응(W399의 각도 변화)만이 아닌 추가적으로 다음 lid loop의 움직임을 설명하고 있다. 이러한 연구는 기존의 단순 “경쟁적 저해제를 통해 CRY1의 생체시계를 조절할 수 있다.” 라는 결론을 화합물로 인한 구조변화가 UB 조절에 영향을 준다는 사실처럼 더 정밀히 물질의 특징을 선별할 수 있는 특징을 뽑아낼 수 있다는 점이다. 두번째 시사점은 바로 빛에 의한 영향을 구조적 형태로 해석하고 분석할 수 있다는 것이다. Simulation을 통해서 빛에 의한 영향은 분석하기 굉장히 영역인데 인데, benzophenone 모이어티의 독특한 conformation을 분석해 빛에 의한 영향까지 해석이 확장할 수 있었다.